/ NIPT妊娠肿瘤

作者/毛茂编辑/卜三少@ Gene Hui

北京时间2019年4月13日，华大基因与国内外数十家医院，亚洲及相关欧洲机构合作三年，共发现1。无创产前筛查（NIPS）过程中有9.03亿孕妇。癌症的研究成果已经发表[1]。这是历史上最大的遗传大深圳助孕知名坤和助孕数据研究。 CDP算法首次发布，它反映了妇产科和肿瘤学，临床主诉以及患者信息的进展。以下是对相应作者博士 Mao Mao和Genehui（欢迎讨论，对评论最多的读者将收到一本Genehui书）。

*谢谢：文学通讯员毛茂老师在基因会讲解。

*邀请：通讯作者将发表有关文献的第一本解释，而Gene Hui将免费出版。

关键点：

1）历史上最大的基因组大数据研究。

2）该领域最系统，最详细的研究是寻找非侵入性的产前遗传学检测来检测怀孕期间的肿瘤。

3）首次发布了一种有效的算法CDP，该算法用于无创性产前基因测试以检测怀孕期间的肿瘤，并结合了肿瘤标志物。

4）如何报告和编制有关NIPS怀孕期间意外发现肿瘤的指南。 该研究的数据提供了指导。

图1：无创产前基因筛查（NIPS）的示意图

也就是说，通过孕妇的血液筛查DNA癌症的遗传疾病。

1。为什么要进行这项研究（研究目的）

1）采用现代人的观念和“二胎”政策，延长了妇女的妊娠期，增加了老年妇女的人数，增加了孕妇患恶性肿瘤的几率。

2）同时，在怀孕期间避免常规检查，例如X射线，CT和MRI，并且肿瘤标志物受怀孕影响，导致无法及时有效地检测出孕妇的肿瘤。

3）NIPT筛查中的多染色体非整倍性可能与母亲恶性肿瘤有关，导致无创性产前筛查（NIPS）失败，但是常规NIPS可能会替代母亲肿瘤和选择性。

在此基础上，华大基因与国内外数十家医院以及亚欧相关机构合作了三年，对近200万例进行了大规模研究。

图2：研究中发现的肿瘤类型和数量从文献中发现的癌症分期（NA未知）[1]

图3：用于效果评估的Kaplan-Meierplots

2。科学家发现了什么？（研究结果和目的）

对超过1个记录的回顾性研究。接受NIPS的9300万孕妇证实了639名孕妇的残留物中存在多染色体非整倍性。在这639名受试者中，有41名妇女被诊断出患有恶性肿瘤。多个染色体非整倍性可预测PPV（阳性预测值，阳性预测值深圳南方国际）为7的母体肿瘤。6％。结合血浆肿瘤标记物检测开发的CDP（cancerdetectionpipeline）算法产生的PPV为75。0％。

文章结果表明，NIPS检测中的CDP算法可以诊断多染色体非整倍体阳性孕妇中具有合理PPV的隐匿性母体恶性肿瘤，血浆肿瘤标志物的检测效果更好。

图4：来自文献的癌症诊断算法的CDP流程图[1]

3。这项研究的主要方法（方法）

记录1。2016年1月至2017年12月之间，有9300万孕妇接受了NIPS。 在最初的NIPS测试中检测到多位非整倍体染色体阳性的639名孕妇。怀孕期间发现的41例肿瘤患者来自亚洲地区，例如中国和欧洲。

根据基因组图谱分析基因拷贝数变异（CNV），并开发出癌症风险算法CDP，比较多个染色体非整倍性，CDP模型以及CDP和血浆肿瘤标志物的组合，以计算诊断母体恶性肿瘤的敏感性性，确切性和阳性性 预测值。

Dr. 毛茂，医学博士

SeekIn的创始人兼首席执行官

倡导遗传和健康数据共享。他于1996年毕业于上海第二医科大学，并在著名的血液学和遗传学专家王振义和陈竺的带领下进修。上海国家人类基因组中心的创始成员。30年的临床，遗传学，基因组学和药物开发经验。辉瑞公司在默克公司工作了15年，从事药物基因组学和分子诊断的研究。美国FDA批准的乳腺癌预后试剂盒MammaPrint的发明者之一（世界上第一个多变量测试方法，于2007年批准）。他还曾担任过妇产科医生和遗传咨询师。 他在SCI期刊上发表了100多篇学术论文，并获得了教育部杰出青年教师奖，上海银蛇奖和上海曙光学者等荣誉和成就。

注意：这项研究是由Dr. 毛茂时任华大基因研究院首席科学家。

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通讯作者的解释（讨论）

1。重要的历史意义和亮点

这是历史上最大的基因组大数据研究。这也是在非侵入性产前基因检测领域发现妊娠期肿瘤的最系统，最详细的研究。

同时，为了提高有效性，该项目开发了一种非侵入性的产前基因测试数据CDP来在怀孕期间找到该算法，并已进行了验证以减少假阳性。同时，血浆肿瘤标志物（PTM）被合并以进一步增加PPV。

NIPS意外地发现了如何在怀孕期间报告肿瘤。 该研究为数据提供了指导，并将在将来逐渐成为临床指导的参考。

除了从产科的角度来看，该研究的其他临床肿瘤学思路通常还包括用于分析癌症存活率的Kaplan-Meierplots作图方法。

2。此方法不能用作肿瘤筛查

需要特别好的是，该研究主要集中在通过NIPT / NIPS意外发现妊娠肿瘤，并且由于灵敏度得到了提高，因此不能用作妊娠期间早期筛查的方法。

3。NIPT / NIPS提供有关孕产妇和儿童健康政策准则的指南

发生多种非整倍性的重组。03％（17。从一年到2017年，有5800万新生儿）与以前的相关研究一致，为NIPS的大数据研究和公共卫生提供了更多数据支持。特别是在NIPT / NIPS中意外发现了妊娠肿瘤，为后续产科，肿瘤学和遗传学相关指南提供了案例参考。

4。NIPT / NIPS技术仍需完善，行业仍有发展空间

目前，国内的华大基因，贝瑞康，大安基因，天昊诊断（自然流产组织），南海高科技等机构已获得染色体非整倍性（T21，T18，T13）检测试剂盒的资质。 还积极部署NIPTPlus（扩大了具有微复制和其他长度范围的孕妇的非侵入性产前基因筛查的范围）。 NMPA还在2017年发布了染色体非整倍性（T21，T18，T13）检测试剂。盒子登记技术审查指南（高通量计量）[3]。Capital还使用NIPT / NIPS作为成熟的途径。但是，我们可深圳不孕不育医院排名以看到，目前的产品仅能解决部分疾病筛查/诊断问题，技术仍需进一步继承，并且该行业尚未形成绝对垄断（不包括某些企业的某些地方政府渠道模式）。

5， 孕妇在进行NIPS时是否了解意外肿瘤？

根据一些家庭临床医生的说法，可能没有通知在患者主诉之外发现其他疾病呈阳性的患者。可能会使一小部分癌症患者受益于其癌症风险，可以及时进行诊断和治疗，但是多染色体非整倍性结果假阳性率高将导致最终孕妇的预期压力以及随后的可能 有创随访检测。另一方面，这是患者知情权和医患沟通系统的复杂因素，其中包括临床遗传学，妇产科和肿瘤学不同领域的专家的不同见解。

通过扩展，患者是否抱怨不相关的疾病（也就是说，患者在检查过程中发现了A病，并且偶然发现了B病）？

在《中国遗传学杂志》 2018年发表的《关于临床基因检测报告规范和基因检测行业共识的讨论》中（您可以输入“阅读报纸”，然后单击地图上的搜索和下载）进行下载： 发现人的知情同意请求还需要列出明确的致病变异和分解解释，与主要投诉无关的其他人则不需要在报告中重复。 中信祥亚的专家后来提出了不同的看法，说：“除非是偶然的发现需要报告，否则如果医生和患者有特殊需要，可以酌情将其包括在附件中。 “除了考虑医患沟通系统，科学性和干预措施的可及性外，编辑们建议，在这种尖端科学方法中还需要考虑其他考虑因素，并且应对相关政策进行监督和系统平衡，以应对相关风险。 通过不成熟的技术，包括受试者，第三方测试机构，临床医生，医院，保险机构等。

附件：通过NIPT意外发现恶性肿瘤的病例信息

（部分参考